Bilim İnsanları Kanser Tümörlerini Avlamak İçin “Metal Dedektörü” Geliştirdi

Cancer Research UK ve Ulusal Sağlık ve Bakım Araştırmaları Enstitüsü (NIHR) tarafından desteklenen araştırmacılar, immünoterapiye daha duyarlı olan kanser tümörlerini tespit eden yeni bir algoritma geliştirdi. “PRRDetect” adlı bu yöntem, DNA onarımı bozuk tümörleri avlayarak kişiselleştirilmiş tedavilerin önünü açmayı hedefliyor.

DNA Tamir Mekanizması Bozuk Tümörler Hedefleniyor

Cambridge Üniversitesi ve NIHE Cambridge Biyomedikal Araştırma Merkezi’daki ekip, 7 farklı kanser türünden 4.775 tümörün tam genom dizilimini inceledi. “DNA tamir bozukluğu” (PRRd) olan tümörlerin, bağışıklık sistemi tarafından daha kolay hedeflendiği biliniyor. PRRDetect algoritması, bu tümörleri genom verileri üzerinden belirlemek için geliştirildi.

“İndel” Mutasyonları Anahtar Rol Oynuyor

Araştırmada, DNA diziliminde ekleme veya silme şeklinde gerçekleşen “indel” mutasyonlarının alışılmadık kalıpları analiz edildi. Bu kalıplar, DNA tamir mekanizması bozuk tümörlerde daha belirgindi. PRRDetect, bu anormallikleri tarayarak hangi hastaların immünoterapiden daha fazla yarar göreceğini tahmin edebiliyor.

Kişiselleştirilmiş Tedaviler İçin Yeni Bir Araç

Çalışmanın lideri Prof. Serena Nik-Zainal, “Tümör genomu artık rutin klinik testler arasında yer alacak. PRRDetect gibi araçlar, doktorların tedaviyi kişiselleştirmesine yardımcı olacak” açıklamasını yaptı. Özellikle akciğer kanseri ve beyin tümörü gibi zorlu vakalarda bu yöntemin umut vaat ettiği için altı çizildi.

100.000 Genom Projesi Verileri Kullanıldı

Araştırma, NHS hastalarından toplanan 100.000 Genom Projesi verilerine dayanıyor. Bilim insanları, bağırsak, mide, mesane gibi kanser türlerinde 37 farklı indel kalıbı tespit etti. Bunların 8’i DNA tamir bozukluğuyla, 19’u ise henüz bilinmeyen mekanizmalarla ilişkili çıktı.

Kaynak: Cancer Research UK ve NIHR iş birliğiyle yürütülen çalışma, Nature Genetics dergisinde yayımlandı.